反渗透（RO）是供参考选择的、紧跟于超滤排放液之后的可获得RO浓缩液和RO渗透液的单元。

它由与超滤液贮箱相连的泵供料，超滤液进入该单元后制得的RO渗透液返回电泳系统，而含有离子成分的RO浓缩液∏则被适量排放，这个过程有效地降低排放废料量和溶剂使用量，因为溶剂返回到RO渗透液，当用RO渗透液代替最终的去离子水冲洗时，由于取消了电泳过程中冲洗水的排放，因此，循环进一步封闭，在最后冲洗中损失的漆料得到回收，去离子水消耗下降，废水处理费用降低。

象超滤一样，反渗透也是一个膜分离过程，虽然RO与UF膜可以有相同的化学组成，但是RO膜比UF膜的透过率更小。

UF膜让小的离子和有机物质通过，RO膜不让离子和分子量很低的有机物通过。进入RO单元的UF渗透『液量的60-75%成为RO渗透液，这个百分数（渗透/进入）称为单元回收率。进料量的25-40%不透过膜，这样，在RO渗透液、浓缩液和进料液里的溶剂含量基本相同，也即60-75%的溶剂被回收。

RO单元由四个压力容器（PV）来描述，一部分浓缩回去可提高回收率，清洁槽（CIP）允许通过计量的化学物质再循环清洗，pH控制系统含有一个pH电极和加酸的泵，维持进料液的pH值为5.0±0.2。

用RO渗透液进行封闭冲洗是反渗透对电泳系统的另一个作用，UF液主要用来喷淋刚电泳后的工件，随后通常用去离子水冲洗，然后排放，而这部分排放的冲洗液中含有涂料，因此，若结合RO冲洗则可减少涂料消耗、去离子水的使用量和◤废水处理量。